Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm32540-201ENSMUST00000207174 1872 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Olfr62-201ENSMUST00000102666 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm14111-201ENSMUST00000119851 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Cyp2j15-ps-201ENSMUST00000122267 686 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Plxna4os3-201ENSMUST00000127668 269 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm45225-201ENSMUST00000206852 1139 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 AC134439.3-201ENSMUST00000223486 851 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 AC116797.2-203ENSMUST00000225290 565 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 BC048562-201ENSMUST00000057265 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm8055-201ENSMUST00000099956 1008 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Rhox4a-201ENSMUST00000115194 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Banf2os-201ENSMUST00000124061 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Wdr17-204ENSMUST00000129132 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm7847-201ENSMUST00000151645 777 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 AC129590.1-201ENSMUST00000225573 852 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Smim4-201ENSMUST00000049732 311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Olfr1155-201ENSMUST00000099843 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r9a-206ENSMUST00000175962 3769 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm24471-201ENSMUST00000104485 131 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Rhox10-201ENSMUST00000115150 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Naa38-204ENSMUST00000144531 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm12976-201ENSMUST00000150171 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm3752-202ENSMUST00000167833 450 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm10128-201ENSMUST00000171360 615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm2956-202ENSMUST00000178722 450 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm10340-202ENSMUST00000188235 615 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 1700063D05Rik-203ENSMUST00000191461 666 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm37819-201ENSMUST00000194626 1065 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm32102-201ENSMUST00000196885 241 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Lysmd4-203ENSMUST00000207757 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 AC163351.1-201ENSMUST00000225539 737 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Tex29-201ENSMUST00000033909 822 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm38309-201ENSMUST00000192063 1518 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Tph1-202ENSMUST00000107669 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 1700092E19Rik-202ENSMUST00000154703 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms