Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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ChfrQ810L3 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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ChfrQ810L3 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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ChfrQ810L3 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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ChfrQ810L3 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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ChfrQ810L3 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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ChfrQ810L3 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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ChfrQ810L3 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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ChfrQ810L3 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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ChfrQ810L3 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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ChfrQ810L3 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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