Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Clec18aQ7TSQ1 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Clec18aQ7TSQ1 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms