Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN7

Hltf, Helicase-like transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HltfQ6PCN7 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Gm1627-201ENSMUST00000188504 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HltfQ6PCN7 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms