Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Plod1-201ENSMUST00000019199 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm12830-201ENSMUST00000137570 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm44699-201ENSMUST00000208229 5083 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 AC134898.1-201ENSMUST00000223738 1836 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Mpo-201ENSMUST00000020779 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm44189-201ENSMUST00000204387 3083 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm31135-201ENSMUST00000208460 1782 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Lnpk-203ENSMUST00000111993 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm37048-201ENSMUST00000194827 5578 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap4-205ENSMUST00000114407 3051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Patj-205ENSMUST00000107030 2104 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb37-205ENSMUST00000171748 2141 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Fkbp5-206ENSMUST00000177939 3844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1214-202ENSMUST00000216026 2126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Dhcr7-202ENSMUST00000124340 2556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Heatr4-201ENSMUST00000164935 3038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Mthfd1-206ENSMUST00000220046 3040 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Stat6-201ENSMUST00000092074 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 4933427D06Rik-204ENSMUST00000168837 2467 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Pde4b-201ENSMUST00000030251 1923 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Copa-206ENSMUST00000135192 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm30414-201ENSMUST00000194886 2596 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Hspd1-ps4-201ENSMUST00000121815 1668 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Rpgrip1-213ENSMUST00000181401 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Zfp532-201ENSMUST00000049016 5503 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms