Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm31466-201ENSMUST00000195457 916 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Prss23os-203ENSMUST00000208814 975 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Prss23os-204ENSMUST00000209064 972 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm29487-201ENSMUST00000190146 256 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Fkbp6-203ENSMUST00000201784 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms