Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm10857-201ENSMUST00000195343 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pitx2P97474 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms