Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Otx2P80206 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Otx2P80206 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Fermt1-201ENSMUST00000038280 4915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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