Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 AC153512.3-201ENSMUST00000220426 662 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms