Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.1 ms