Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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