Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Pear1-202ENSMUST00000079083 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Adamtsl1-209ENSMUST00000141889 7805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Fbxo7-204ENSMUST00000130320 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Olfr943-202ENSMUST00000213176 8275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Adamts6-201ENSMUST00000065766 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Pkd1l2-202ENSMUST00000109093 7389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms