Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms