Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScaperF8VQ70 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScaperF8VQ70 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScaperF8VQ70 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScaperF8VQ70 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScaperF8VQ70 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScaperF8VQ70 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScaperF8VQ70 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScaperF8VQ70 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScaperF8VQ70 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScaperF8VQ70 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScaperF8VQ70 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScaperF8VQ70 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScaperF8VQ70 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScaperF8VQ70 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScaperF8VQ70 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScaperF8VQ70 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScaperF8VQ70 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScaperF8VQ70 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ScaperF8VQ70 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ScaperF8VQ70 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScaperF8VQ70 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScaperF8VQ70 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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