Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Hdac5Q9Z2V6 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms