Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Cldn22Q9D7U6 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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