Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms