Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms