Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms