Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Slc12a5-209ENSMUST00000202623 3574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Zmpste24-201ENSMUST00000058754 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Daam2-201ENSMUST00000057610 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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