Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm42875-201ENSMUST00000197674 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm42764-201ENSMUST00000197835 741 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 4930547H16Rik-201ENSMUST00000222281 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Ifitm7-202ENSMUST00000178021 1823 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm5910-201ENSMUST00000211819 1746 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Bpifb2-201ENSMUST00000028983 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm436-201ENSMUST00000105747 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm8661-201ENSMUST00000118688 992 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm12240-201ENSMUST00000120178 229 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Pkib-204ENSMUST00000175852 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Rpl21-ps2-201ENSMUST00000222933 481 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 AC124555.1-201ENSMUST00000227051 880 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Mettl7b-201ENSMUST00000026398 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 4933427E13Rik-201ENSMUST00000044347 381 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Rpl15-ps3-201ENSMUST00000088480 615 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Anapc15-203ENSMUST00000098237 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 CT009713.3-201ENSMUST00000224987 1565 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Zscan5b-203ENSMUST00000165445 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Arg2-201ENSMUST00000021550 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm12362-201ENSMUST00000121986 342 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm17171-201ENSMUST00000168048 534 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Crip1-206ENSMUST00000200553 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm7924-201ENSMUST00000203975 785 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm8174-201ENSMUST00000064353 1001 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm10689-201ENSMUST00000098864 432 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Mtbp-201ENSMUST00000022998 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Tbce-201ENSMUST00000039894 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Tmem29-201ENSMUST00000059256 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm8955-201ENSMUST00000182945 1008 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Rwdd2a-203ENSMUST00000185566 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm38301-201ENSMUST00000195573 543 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Gm42952-204ENSMUST00000198572 408 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hecw1Q8K4P8 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms