Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Hdac7Q8C2B3 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Hdac7Q8C2B3 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Hdac7Q8C2B3 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Hdac7Q8C2B3 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Hdac7Q8C2B3 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.7 ms