Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms