Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.3 ms