Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ccdc88cQ6VGS5 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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