Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Zbtb40Q6PCS8 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Zbtb40Q6PCS8 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Zbtb40Q6PCS8 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Zbtb40Q6PCS8 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Zbtb40Q6PCS8 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Zbtb40Q6PCS8 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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Zbtb40Q6PCS8 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Zbtb40Q6PCS8 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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Zbtb40Q6PCS8 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Zbtb40Q6PCS8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbtb40Q6PCS8 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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