Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms