Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28047Q3US59 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28047Q3US59 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28047Q3US59 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28047Q3US59 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28047Q3US59 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28047Q3US59 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28047Q3US59 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28047Q3US59 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28047Q3US59 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28047Q3US59 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28047Q3US59 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28047Q3US59 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28047Q3US59 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28047Q3US59 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28047Q3US59 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28047Q3US59 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28047Q3US59 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28047Q3US59 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28047Q3US59 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28047Q3US59 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28047Q3US59 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28047Q3US59 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28047Q3US59 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm28047Q3US59 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Gm28047Q3US59 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Gm28047Q3US59 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Gm28047Q3US59 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Gm28047Q3US59 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Gm28047Q3US59 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Gm28047Q3US59 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Gm28047Q3US59 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Gm28047Q3US59 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Gm28047Q3US59 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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