Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrprbP47758 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SrprbP47758 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrprbP47758 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrprbP47758 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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SrprbP47758 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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SrprbP47758 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SrprbP47758 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
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SrprbP47758 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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SrprbP47758 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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SrprbP47758 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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