Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Zbtb43-201ENSMUST00000028125 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Fhad1-203ENSMUST00000105780 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
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