Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms