Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms