Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm13855-201ENSMUST00000145644 744 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Cdrt4os1-202ENSMUST00000153180 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm13012-202ENSMUST00000155349 849 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms