Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gria4-201ENSMUST00000027020 5441 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Trpm5-201ENSMUST00000009390 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Abcc9-206ENSMUST00000205202 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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Gm17577J3QNF7 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Gm17577J3QNF7 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Gm17577J3QNF7 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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Gm17577J3QNF7 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Gm17577J3QNF7 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Gm17577J3QNF7 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Gm17577J3QNF7 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Olfm3-202ENSMUST00000081752 4647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Gm17577J3QNF7 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Prdm16-204ENSMUST00000105636 8426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Brca2-210ENSMUST00000202313 10517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
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