Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms