Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Vamp5Q9Z2P8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vamp5Q9Z2P8 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Vamp5Q9Z2P8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vamp5Q9Z2P8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vamp5Q9Z2P8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Vamp5Q9Z2P8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vamp5Q9Z2P8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vamp5Q9Z2P8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vamp5Q9Z2P8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vamp5Q9Z2P8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vamp5Q9Z2P8 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vamp5Q9Z2P8 Sntg1-207ENSMUST00000140295 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vamp5Q9Z2P8 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vamp5Q9Z2P8 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Mtor-202ENSMUST00000103221 8564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Rsf1-201ENSMUST00000107153 11124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Anxa7-207ENSMUST00000224975 2727 ntAPPRIS P2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Plec-205ENSMUST00000073418 15455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Irf4-202ENSMUST00000110307 4761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Irf4-201ENSMUST00000021784 4764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Ndn-201ENSMUST00000038775 3694 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Wiz-203ENSMUST00000087703 4175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 1700126A01Rik-201ENSMUST00000185283 2061 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Mre11a-202ENSMUST00000115632 5660 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 2410002F23Rik-202ENSMUST00000071296 4201 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Tirap-201ENSMUST00000175765 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 AC159819.3-201ENSMUST00000216940 1837 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Heatr4-201ENSMUST00000164935 3038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Amotl1-206ENSMUST00000223132 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Foxm1-201ENSMUST00000073316 4652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Htr1a-201ENSMUST00000022235 4484 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Rreb1-201ENSMUST00000037232 8395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 4930570G19Rik-201ENSMUST00000139363 3112 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Acot12-201ENSMUST00000022120 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Fxr1-208ENSMUST00000200392 3014 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Nrep-201ENSMUST00000051087 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Actr2-201ENSMUST00000000137 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Xpnpep3-201ENSMUST00000041609 3236 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 AC153940.1-201ENSMUST00000220149 5300 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Zfp541-201ENSMUST00000108509 4561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 AY702103-202ENSMUST00000180996 5876 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vamp5Q9Z2P8 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.8 ms