Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Cd300a-202ENSMUST00000106582 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Egf-201ENSMUST00000029653 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Ctnnd1-209ENSMUST00000111678 5870 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Crispld2-203ENSMUST00000132583 4182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Helz2-201ENSMUST00000094203 9162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Scn2b-202ENSMUST00000170998 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Pkd1l3-203ENSMUST00000212537 6576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Nav2-202ENSMUST00000064395 11317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Boc-201ENSMUST00000114634 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Tbck-202ENSMUST00000169172 6578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 2900060N12Rik-201ENSMUST00000221412 3721 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms