Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
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Smg9Q9DB90 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
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Smg9Q9DB90 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
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Smg9Q9DB90 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Smg9Q9DB90 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Smg9Q9DB90 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Smg9Q9DB90 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Smg9Q9DB90 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Smg9Q9DB90 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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