Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB85

Rrp8, Ribosomal RNA-processing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp8Q9DB85 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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