Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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