Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdm1Q9CQK3 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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