Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Olfr543-202ENSMUST00000219647 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm14370-201ENSMUST00000122460 868 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm15273-201ENSMUST00000142302 868 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm7023-201ENSMUST00000147295 868 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm26356-201ENSMUST00000158217 283 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm14357-201ENSMUST00000178352 868 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm14361-201ENSMUST00000178547 868 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm14348-201ENSMUST00000179183 868 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Olfr1384-201ENSMUST00000060434 1034 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rims1Q99NE5 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms