Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms