Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TardbpQ921F2 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms