Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgdsQ8VDR7 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms