Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms