Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Spata7-202ENSMUST00000101144 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Igsf5-204ENSMUST00000113795 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm17120-201ENSMUST00000164734 743 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Cryab-206ENSMUST00000217475 1117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Mgst2-201ENSMUST00000099106 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Hdac9-208ENSMUST00000211107 1683 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Fhl3-202ENSMUST00000106199 1139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm8661-201ENSMUST00000118688 992 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm11629-201ENSMUST00000123784 384 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm9075-201ENSMUST00000168738 794 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 BC048562-201ENSMUST00000057265 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Vgll3-202ENSMUST00000227997 1383 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 A830018L16Rik-203ENSMUST00000137824 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Apoo-201ENSMUST00000113895 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm16008-203ENSMUST00000181389 480 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 1700019D03Rik-206ENSMUST00000190831 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 AC134898.1-201ENSMUST00000223738 1836 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Serpina1b-201ENSMUST00000095450 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Tmem254c-201ENSMUST00000100818 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Wdr17-204ENSMUST00000129132 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm15208-201ENSMUST00000134448 493 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm23555-201ENSMUST00000157815 135 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm5259-201ENSMUST00000191231 800 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm34780-201ENSMUST00000193896 949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm13861-201ENSMUST00000137136 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 AC116390.1-201ENSMUST00000227975 670 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm8174-201ENSMUST00000064353 1001 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 5830473C10Rik-202ENSMUST00000200765 1691 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Mcph1-205ENSMUST00000146819 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms