Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Atg9aQ68FE2 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms