Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms