Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Usp48Q3V0C5 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Usp48Q3V0C5 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Usp48Q3V0C5 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Usp48Q3V0C5 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Usp48Q3V0C5 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Usp48Q3V0C5 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Usp48Q3V0C5 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Usp48Q3V0C5 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms